ICTV

Akronym für International Committee on Taxonomy of Viruses. Dieses Kommittee hat auf der Basis gesammelter morphologischer, molekularer und biologischer Eigenschaften von Viren eine Klassifikation von Viren erarbeitet.

Die ältere Baltimore-Klassifikation gilt als überholt.  Diese Klassifikation wurde auf der Grundlage des Wissens um die Molekularbiologie der Viren vorübergehend etabliert. Sie geht auf einen Vorschlag des Nobelpreisträgers David Baltimore von 1971 zurück.

Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ist mit der Entwicklung, Verfeinerung und Aufrechterhaltung einer universellen Virustaxonomie beauftragt. Diese Aufgabe umfasst die Klassifizierung von Virusarten und höherstufigen Taxa nach den genetischen und biologischen Eigenschaften ihrer Mitglieder; Benennung von Virus taxa; Pflege einer Datenbank, in der die derzeit genehmigte Taxonomie detailliert beschrieben wird; und Bereitstellung der Datenbank, unterstützender Vorschläge und anderer virusbezogener Informationen von einer öffentlichen Website mit offenem Zugang. Die ICTV-Website (http://ictv.global) bietet Zugriff auf die aktuelle Taxonomie-Datenbank in Online- und herunterladbaren Formaten und führt eine vollständige Geschichte der Virustaxa bis zur ersten Veröffentlichung im Jahr 1971. Die Datenbank enthält eine umfassende Beschreibung aller Virustaxa, die die Virusstruktur, Genomstruktur, Biologie und Phylogenetik abdecken. Der neunte ICTV-Bericht, der 2012 veröffentlicht wurde, ist als Open-Access-Online-Publikation auf der ICTV-Website verfügbar. Der aktuelle, 10. Bericht (http://ictv.global/report/) wird online veröffentlicht und ersetzt die bisherige Hardcopy-Ausgabe durch eine vollständig offene, ständig aktualisierte Publikation.

Das High-throughput sequencing (HTS)  und seine Verwendung bei der Wiederherstellung und Zusammenfügen neuartiger Virussequenzen aus Umwelt-, klinischen, tierärztlichen und pflanzlichen Proben haben einen riesigen neuen Katalog von Viren freigelegt (Lefkowitz EJ et al. 2018). Ihre Klassifizierung, die allein durch ihre Sequenzen bekannt ist, stellt eine große Herausforderung für die traditionelle Virustaxonomie dar, insbesondere auf der Ebene der Familie und der Arten, die historisch weitgehend auf beschreibenden Taxon-Definitionen basieren. Diese beinhalten in der Regel einige Kenntnisse über ihre phänotytischen Eigenschaften, einschließlich Replikationsstrategien, Virionsstruktur und klinische und epidemiologische Merkmale, wie Host-Bereich, geografische Verteilung und Krankheitsergebnisse. Für Viren, die in metagenomischen Datensätzen identifiziert wurden, sind jedoch nur wenige bis gar keine Informationen verfügbar. Wenn solche Viren in die Virustaxonomie aufgenommen werden sollen, müssen ihre Zuordnungen weitgehend oder vollständig von Metriken genetischer Verwandtschaften geleitet werden. Das unmittelbare Problem dabei ist, dass das Internationale Komitee für Taxonomie von Viren (ICTV), eine Organisation, die die taxonomische Klassifizierung von Viren genehmigt, wenig oder gar keine Anleitung dafür gibt, wie ähnlich oder wie unterschiedlich Viren sein müssen, um als Mitglieder neuer Arten oder neuer Familien betrachtet zu werden. Ein schnelles und objektives Mittel, um die metagenomische virale Vielfalt zu erforschen und evidenzbasierte Zuordnungen für solche Viren auf jeder taxonomischen Schicht zu machen, ist unerlässlich. Die Analyse von Sequenzen kann Beweise dafür liefern, dass Familienzuweisungen (und Gattungen) von derzeit klassifizierten Viren weitgehend durch genomische Verwandtschaft untermauert werden, und diese Merkmale könnten als Leitfaden für eine evidenzbasierte Klassifizierung von metagenomischen Viren in der Zukunft dienen (Simmonds P et al. (2018).

1. Simmonds P et al. (2018) Virus classification - where do you draw the line? Arch Virol 163:2037-2046.
2. Lefkowitz EJ et al. (2018) Virus taxonomy: the database of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Nucleic Acids Res 46: D708-D717.