RNA-in-situ-Hybridisierung

RNA-in-situ-Hybridisierung ist eine Methode zum direkten und spezifischen Nachweisvon RNA) in Gewebe, Zellen, Zellkompartimenten und Chromosomen (s.a. FISH). Die RNA-in-situ-Hybridisierung erlaubt im Gegensatz zu früheren Anwendungen den Nachweis einzelner Moleküle am formalinfixierten und in Paraffin eingebetteten Gewebe ohne zusätzlichen Aufwand im Labor, da die Tests auf gängigen Laborautomaten laufen und im Lichtmikroskop ausgewertet werden können. Gegenüber molekularen Methoden wie RT-PCR oder Whole-genome-Analysen bleibt bei RNA-ISH die Gewebemorphologie erhalten und bietet so den entscheidenden Vorteil der Lokalisation der Zielzellen im Gewebe.

1. Anderson CM et al. (2018) Visualizing genetic variants, short targets, and point mutations in the morphological tissue context with an RNA in situ hybridization assay. J Vis Expdoi.org/10.3791/58097
2. Anderson CM et al. (2016) Fully automated RNAscope in situ hybridization assays for formalin-fixed paraffin-embedded cells and tissues. J Cell Biochem 117:2201–2208.
3. Antonarakis ES et al. (2015) Androgen receptor splice variant 7 and efficacy of Taxane chemotherapy in patients with metastatic castration-resistant prostate cancer. JAMA Oncol 1:582–591.
4. Baena-Del Valle JA et al. (2017) Rapid Loss of RNA Detection by In Situ Hybridization in Stored Tissue Blocks and Preservation by Cold Storage of Unstained Slides. Am J Clin Pathol 148:398–415.
5. Baker AM et al. (2017) Robust RNA-based in situ mutation detection delineates colorectal cancer subclonal evolution. Nat Commun doi.org/10.1038/s41467-017-02295-5