Stromaufwärts (Genetik)

Als „stromaufwärts“ (upstream) wird die Richtung in einem Nucleinsäuremolekül angezeigt, die in das 5'-Endes des Nucleinsäuremoleküls weist. Als Promotor eines Gens wird i.d.R. der DNA-Abschnitt bezeichnet, der stromaufwärts vom Transkriptionsstart liegt.

Mit den Begriffen stromaufwärts bzw. stromabwärts (upstream und downstream) bezeichnet man in der Molekularbiologie und in der Genetik die Transkriptionsrichtung und die Position von Nukleotidsequenzen, die eine kodierende Region umgeben.

Jeder DNA- oder RNA-Strang besitzt ein 5′- und 3′-Ende, welches sich auf bestimmte Kohlenstoffatome der (Desoxy-)Ribose bezieht. Hierbei wurde festgelegt, dass sich upstream oder downstream auf die 5′→3′-Richtung der DNA-Transkription bezieht. Dabei wird die Transkriptionsrichtung zum 3′-Ende als downstream bezeichnet.

Die entgegengesetzte Richtung zum 5′-Ende wird als upstream bezeichnet. Bei der doppelsträngigen DNA richtet sich dies stets nach dem kodogenen Strang (Matrizen-Strang) des jeweiligen Gens. Aufgrund des spiegelblidlichen Aufbaus der DNA sind upstream und downstream beim Nichtmatrizen-Strang – vom Matrizen-Strang aus betrachtet – umgekehrt.