T-RFLP

T-RFLP ist das Akronym für die terminale RFLP wobei RFLP für Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus steht.  

Bei dieser Technik werden die Zielgene in der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) mit einem (oder beiden) fluoreszenzmarkierten Primer(n) amplifiziert. Die Amplifikationsprodukte werden mit einem Restriktionsenzym verdaut und durch einen automatisierten Sequenzer analysiert.

Die T-RFLP-Technik des amplifizierten Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus wird inzwischen auch zur Analyse von Polymorphismus bei bakteriellen und mykologischen Proben eingesetzt (Masiga DK et al. 2000; Verrier J et al. 2019).  So erwies sich der T-RFLP-Test als hochempfindlich und spezifisch und ermöglicht den schnellen Nachweis und die direkte Identifizierung von Dermatophyten in der ärztlichen Praxis (Verrier J et al. 2019).

1. Amélia Camarinha-Silva et al. (2012) Validating T-RFLP as a sensitive and high-throughput approach to assess bacterial diversity patterns in human anterior nares. FEMS Microbiology Ecology 79: 98–108.
2. Didehdar M et al. (2016) Characterization of clinically important dermatophytes in North of Iran using PCR-RFLP on ITS region. J Mycol Med 26:345-350.
3. Masiga DK et al. (2000) Amplified restriction fragment length polymorphism in parasite genetics. Parasitol Today 16:350-353.
4. Rudner R et al. (1994) Determinations of restriction fragment length polymorphism in bacteria using ribosomal RNA genes. In: Methods in Enzymology. Band 235:184–196
5. Verrier J et al. (2019) PCR-terminal restriction fragment length polymorphism for direct detection and identification of dermatophytes in veterinary mycology. Med Mycol 57:447-456.