T-RFLP

Zuletzt aktualisiert am: 10.09.2024

This article in english

Synonym(e)

terminale RFLP

Kostenlose Fachkreis-Registrierung erforderlich

Bitte melden Sie sich an, um auf alle Artikel, Bilder und Funktionen zuzugreifen.

Unsere Inhalte sind ausschließlich Angehörigen medizinischer Fachkreise zugänglich. Falls Sie bereits registriert sind, melden Sie sich bitte an. Andernfalls können Sie sich jetzt kostenlos registrieren.


Kostenlose Fachkreis-Registrierung erforderlich

Bitte vervollständigen Sie Ihre Pflichtangaben:

E-Mail Adresse bestätigen
oder
Fachkreisangehörigkeit nachweisen.

Jetzt abschließen

Definition

T-RFLP ist das Akronym für die terminale RFLP wobei RFLP für Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus steht.  

Definition

Bei dieser Technik werden die Zielgene in der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) mit einem (oder beiden) fluoreszenzmarkierten Primer(n) amplifiziert. Die Amplifikationsprodukte werden mit einem Restriktionsenzym verdaut und durch einen automatisierten Sequenzer analysiert.

Allgemeine Information

Die T-RFLP-Technik des amplifizierten Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus wird inzwischen auch zur Analyse von Polymorphismus bei bakteriellen und mykologischen Proben eingesetzt (Masiga DK et al. 2000; Verrier J et al. 2019).  So erwies sich der T-RFLP-Test als hochempfindlich und spezifisch und ermöglicht den schnellen Nachweis und die direkte Identifizierung von Dermatophyten in der ärztlichen Praxis (Verrier J et al. 2019).

Literatur

  1. Amélia Camarinha-Silva et al. (2012) Validating T-RFLP as a sensitive and high-throughput approach to assess bacterial diversity patterns in human anterior nares. FEMS Microbiology Ecology 79: 98–108.
  2. Didehdar M et al. (2016) Characterization of clinically important dermatophytes in North of Iran using PCR-RFLP on ITS region. J Mycol Med 26:345-350.
  3. Masiga DK et al. (2000) Amplified restriction fragment length polymorphism in parasite genetics. Parasitol Today 16:350-353.
  4. Rudner R et al. (1994) Determinations of restriction fragment length polymorphism in bacteria using ribosomal RNA genes. In: Methods in Enzymology. Band 235:184–196
  5. Verrier J et al. (2019) PCR-terminal restriction fragment length polymorphism for direct detection and identification of dermatophytes in veterinary mycology. Med Mycol 57:447-456.

Zuletzt aktualisiert am: 10.09.2024