SETD2-Gen
Synonym(e)
Definition
SETD2 (SET Domain Containing 2, Histone Lysine Methyltransferase) ist ein Protein kodierendes Gen, das auf Chromosom 3p21.31 lokalisiert ist. SETD2 ist das einzige menschliche Gen, das für die Trimethylierung von Lysin 36 des Histons H3 (H3K36) verantwortlich ist. Die Auswirkungen dieser Histonmodifikation werden durch H3K36me3-Leser bestimmt, die Proteinkomplexe rekrutieren, um bestimmte Prozesse durchzuführen, darunter die Verlängerung der Transkription, die RNA-Verarbeitung und die DNA-Reparatur. SETD2 vermittelt neben der Histonmethylierung auch die Methylierung von Proteinen, wie Tubuline und STAT1.
Allgemeine Information
Das menschliche SETD2 ist eine Methyltransferase mit 2 Hauptisoformen: Isoform 1 besteht aus 2.564 Aminosäuren und hat ein Molekulargewicht von 287,5 kDa. Isoform 2 ist am N-Terminus 44 Reste kürzer als Isoform 1 und besteht aus 2520 Aminosäuren mit einem Molekulargewicht von 282,6 kDa. SETD2 ist eine Lysin-Methyltransferase und ein Transkriptionsregulator, der an der Histonmodifikation, der DNA-Reparatur, der mRNA-Regulation, der Genomstabilität, dem alternativen Spleißen und der Interferon-α-Signalisierung beteiligt ist.
Die Methyltransferase wirkt als Schlüsselregulator der DNA-Fehlpaarungsreparatur in G1 und der frühen S-Phase, indem es H3K36me3 erzeugt, eine Markierung, die für die Rekrutierung der MSH6-Untereinheit des MutS-alpha-Komplexes erforderlich ist: Die frühe Rekrutierung des MutS-alpha-Komplexes an das zu replizierende Chromatin ermöglicht eine schnelle Identifizierung der Fehlpaarungs-DNA. Damit kann die „Fehlpaarungs-Reparaturreaktion“ eingeleitet werden.
Hinweis(e)
SETD2- Mutationen sind assoziiert mit klarzelligem Nierenzellkrebs (Li J et al. 2016; Piva Fet al. 2015), dem hepatosplenischen T-Zell-Lymphom und dem Peripheren T-Zell Lymphom (NOS) (Ji MM et al. 2018; Yabe M et al. 2018)
Zu den Krankheiten, die mit SETD2 assoziiert sind, gehören die Großwuchssyndrome Luscan-Lumish-Syndrom und das Sotos-Syndrom 2 (Marzin Pet al. 2019).
Literatur
- Ji MM et al. (2018) Histone modifier gene mutations in peripheral T-cell lymphoma not otherwise specified. Haematologica 103: 679-687.
- Li J et al. (2016) SETD2: an epigenetic modifier with tumor suppressor functionality. Oncotarget 7(:50719-50734.
- Marzin Pet al. (2019) SETD2 related overgrowth syndrome: Presentation of four new patients and review of the literature. Am J Med Genet C Semin Med Genet181:509-518.
- Piva Fet al. (2015) BAP1, PBRM1 and SETD2 in clear-cell renal cell carcinoma: molecular diagnostics and possible targets for personalized therapies. Expert Rev Mol Diagn. 15:1201-1210.
- Sun J et al. (2020) Recurrent SETD2 mutation in NPM1-mutated acute myeloid leukemia. Biomark Res 8: 62.
- Yabe M et al. (2018) Hepatosplenic T-cell Lymphoma: a review of clinicopathologic features, pathogenesis, and prognostic factors. Hum Pathol. 74:5-16.