Im weiteren Sinne wird unter Pigmentierung der Haut/Schleimhaut die Einlagerung von Pigmenten (Pigmentum = Farbe, Farbstoff) in Haut, Hautanhangsgebilde (Haare, Nägel), Augen und Schleimhaut bezeichnet. Beim Menschen stellen die Melanine, Hämoglobin in oxydierter Form und dessen Abkömmling das Hämosiderin, Karotinoide sowie die Gallenfarbstoffe die wichtigsten Pigmente dar. Sie definieren in ihrer Zusammensetzung und Dichte die Hautfarbe.
Im engeren Sinne wird unter einer Pigmentierung die melanotische Pigmentierung (s.a. Pigment), d.h. die Einlagerung des " Melanozytenproduktes" Melanin in menschliche Zellen verstanden.