Begriff in der Genetik. Unter einer Spontanmutation wird eine zufällige Mutation verstanden, bei der keine äußeren Ursachen bekannt sind. Beispiel ist der chemische Zerfall eines Nukleotids -Cytosin desaminiert oxidativ spontan zu Uracil-. Da der Großteil der DNA nicht für gEne codiert, werden die meisten spontanen Mutationen nicht wahrgenommen. Erfolgen jedoch Spontanmutationen in einem Gen, kann seine Funktion beeinträchtigt oder komplett verändert werden.
Das Gegenteil einer Spontanmutation ist eine "induzierte Mutation".