LINE1

Line1, auch L1 bezeichnet, sind „Nicht-LTR-Retrotransposons“, die im Laufe der Evolution die größte Umgestaltungskraft des menschlichen Genoms darstellen. Es handelt sich um transponierbare Elemente der Klasse I (Retrotransposons) in der DNA von Organismen. Sie gehören zur Gruppe der long interspersed nuclear elements (LINEs).

Vom menschlichen Genom bestehen etwa 45 % aus transponierbaren Elementen (long interspersed nuclear elements (LINEs), short interspersed nuclear elements (SINEs) und Transposons); 5-8 % stammen von viralen Sequenzen mit Ähnlichkeit zu infektiösen Retroviren. Wenn die Integration des Retrovirus in der Keimbahn erfolgt, sind die integrierten viralen Sequenzen vererbbar (Katsura Y et al. 2019).  

L1 machen ca. 17 % des menschlichen Genoms aus (Cervantes-Ayalc A et al. 2020).

Die Mehrheit der L1 im menschlichen Genom ist inaktiv; jedoch haben ca. 80-100 die Fähigkeit zur Retrotransposition beibehalten, wobei es erhebliche Unterschiede zwischen den Individuen gibt. Diese aktiven L1 können das Genom durch Insertionen, Deletionen, Rearrangements und Kopienzahlvariationen (CNV) verändern.

Die L1-Aktivität hat zur Instabilität und Evolution von Genomen beigetragen und wird in der Keimbahn durch DNA-Methylierung, Histon-Modifikationen und piRNA streng reguliert. L1s können aufgrund ihrer repetitiven DNA-Sequenzen die Genomvariation durch Fehlpaarungen und ungleiches Crossing-over während der Meiose weiter beeinflussen. LINE-1 wird mit der Tumorentstehung in Verbindung gebracht (Rodic N 2018).

1. Cervantes-Ayalc A et al. (2020) Long Interspersed Nuclear Elements 1 (LINE1): The chimeric transcript L1-MET and its involvement in cancer. Cancer Genet 241:1-11.
2. Katsura Y et al. (2019) Evolutionary Medicine of Retroviruses in the Human Genome. Am J Med Sci 358:384-388. 
3.  Rodic N (2018) . LINE-1 activity and regulation in cancer. Front Biosci (Landmark Ed) 23:1680-1686.